Dies sind die Seiten zur Vorlesung Einführung in die angewandte Bioinformatik, die an der TU Dortmund im Sommersemester 2008 von Prof. Dr. Sven Rahmann gehalten wird.
Aktuell
25.07.2008
Der Termin für die zweite Klausur ist der 29.09.2008 um 9 Uhr (im normalen Praktikumsraum).
Die Anmeldeprozedur wird bald bekannt gegeben.
24.07.2008
Die Klausureinsicht findet am Freitag, den 01.08.2008 von 10-12 Uhr in OH 14, Raum 203 statt.
21.07.2008
Wir haben die Klausuren korrigiert. Ihr findet eure Noten auf der Webseite, die ihr auch während der Klausur verwendet habt (hängt an die Adresse dieser Seite einfach "klausur"). Ob und wann die Lösungen online gestellt werden, entscheiden wir noch.
| Punkte | Note | Anzahl |
| unter 22 | nicht bestanden | 8 |
| ab 22 | 4,0 | 3 |
| ab 24 | 3,7 | 1 |
| ab 26 | 3,3 | 4 |
| ab 29 | 3,0 | 7 |
| ab 31 | 2,7 | 5 |
| ab 33 | 2,3 | 6 |
| ab 35 | 2,0 | 7 |
| ab 38 | 1,7 | 8 |
| ab 40 | 1,3 | 6 |
| ab 43 | 1,0 | 1 |
Klausurübung
Die Punktegrenzen für die Bewertung sind folgendermaßen:
| Grenze | Bewertung | Anzahl |
|---|---|---|
| ab 26,5 Punkte | ++ | 5 |
| ab 23,5 Punkte | + | 16 |
| ab 19 Punkte | 0 | 19 |
| ab 14 Punkte | - | 16 |
| unter 14 Punkte | -- | 5 |
| nicht erschienen | -- | 4 |
Ihr findet hier die Lösung für die Klausurübung
Zu Aufgabe 3 der Übungsklausur: Für Nachschreiber ist die richtige Lösung 23673.
Zu Aufgabe 7: CAA36793 ist die Accession-Nummer für ein Protein-Fragment. Führt man dafür die BLAST-Suche durch, ist die Sequenzidentität 51/81 (62%).
Vorlesung
Die Vorlesung richtet sich an Studierende der chemischen Biologie im sechsten Semester. Der Dozent ist Prof. Dr. Sven Rahmann, die Übungsgruppen werden betreut von Dr. Udo Feldkamp und Dipl.-Inform. Marcel Martin.
Die Vorlesung findet donnerstags von 12:15—14:00 Uhr in HS 3 (Gebäude Chemie) statt.
Folien
- 10.04.2008 Einführung
- 10.04.2008 Unix
- 17.04.2008 Literaturdatenbanken
- 24.04.2008 und 08.05.2008 Sequenzdatenbanken (aktualisiert: Diese Datei enthält jetzt auch die Folien vom 08.05.)
- 15.05.2008 Sequenzvergleich mit BLAST
- 05.06.2008 Algorithmik
- 05.06.2008 Multiple Alignments und Clustal
- 12.06.2008 Phylogenetik
- 19.06.2008 und 26.06.2008 Microarrays und R
- 03.07.2008 Proteine
- 10.07.2008 Netzwerke