Vorlesung 2007

Dies ist eine Kopie der alten Seite zur Vorlesung, die im Sommersemester 2007 gehalten wurde

Vorlesung

Inhalt

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Die Vorlesung richtet sich an Studenten der chemischen Biologie im sechsten Semester.

Dozent: Prof. Dr. Sven Rahmann

Folgende Themen werden behandelt:

  • Biologische Literaturdatenbanken
  • Protein- und Gendatenbanken
  • Alignment von Proteinsequenzen
  • Phylogenie
  • Visualisierung von Proteinen
  • Vorhersage von Proteineigenschaften
  • Statistische Analyse mit der Software R
  • Biochemische Netzwerke

Zeit und Ort

  • Ort : Hörsäle ZE 01, ZE 02 und ZE 15 (siehe Tabelle unten bzw. Aushang)
  • Zeiten (16.7. - 20.7.):
8:30 - 13:00 14:00 - 18:00
Montag Vorlesung (ZE 02) Übungen
Dienstag Vorlesung (ZE 01) Vorlesung (ZE 15)
Mittwoch Übungen Übungen
Donnerstag Vorlesung (ZE 01) Übungen
Freitag Prüfung Prüfung

Folien und Materialien

Sie können die Vorlesungsfolien als PDF herunterladen:

1. Einführung
2. Literaturdatenbanken
3. Biologische Datenbanken
4. Sequenzanalyse
5. BLAST und CLUSTAL
6. Phylogenetik
7. Proteinstruktur
8. Microarray Analyse
9. Biologische Netzwerke

Prüfung

Am Freitag, den 20.7., finden die zum Scheinerwerb nötigen Prüfungen statt.
Die Einteilung in die Gruppen und die Prüfungszeiten finden sie hier

Übungen

Veranstalter: Michael Wurst, Udo Feldkamp

Die Übungen finden in zwei Gruppen statt. Die Einteilung erfolgt am ersten Vorlesungstag.

Zeit und Ort

  • Ort: GB IV (Campus Süd), Raum 006 im Kellergeschoss.
  • Zeiten:
8:30 - 13:00 14:00 - 16:00 16:00 - 18:00
Montag Vorlesung Übung Gruppe A Übung Gruppe B
Dienstag Vorlesung Vorlesung Vorlesung
Mittwoch Übungen Gruppe A Übung Gruppe B Übung Gruppe B
Donnerstag Vorlesung Übung Gruppe A Übung Gruppe B

Übungsblatt

Sie können das Übungsblatt als PDF herunterladen.

Sonstige Materialien

Für die Aufgabe zur Phylogenie benötigen Sie folgende Datei mit fünf Proteinsequenzen:

five_species.fasta.txt

Speichern Sie diese Datei in ihr homeverzeichnis.

Links

Allgemein

Literaturdatenbanken

Gen- und Proteindatenbanken und Tools

Phylogenetik

Biologische Netzwerke und Pathwayanalyse

Statistische Analyse mit R

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